Kopš pandēmijas sākuma diagnostiskajai pārbaudei ir bijusi būtiska loma SARS-CoV-2, vīrusa, kas izraisaCOVID 19.Ātrās antigēnu pārbaudesmājās vai klīniskā vidē nodrošina rezultātus 15 minūtēs vai mazāk.Jo agrāk cilvēks tiek diagnosticēts, jo ātrāk viņš var meklēt medicīnisko palīdzību un norobežoties no citiem.Bet, kad parādās jauni vīrusa varianti, šie varianti var netikt atklāti ar šiem testiem.
Lielākā daļa ātro antigēnu testu ir paredzēti SARS-CoV-2 nukleokapsīda proteīna vai N-proteīna noteikšanai.Šis proteīns ir daudz atrodams vīrusu daļiņās un inficētos cilvēkos.Ātrās pārbaudes komplektss parasti satur divas dažādas diagnostiskas antivielas, kas saistās ar dažādām N proteīna daļām.Kad antiviela saistās ar N proteīnu paraugā, testa komplektā parādās krāsaina līnija vai cits signāls, kas norāda uz infekciju.
Proteīns N sastāv no 419 aminoskābju struktūrvienībām.Jebkuru no tiem mutācijas ceļā var aizstāt ar citu aminoskābi.Pētniecības grupa, kuru vadīja Ph.D.Filips Frenks un Ēriks Ortlunds no Emory universitātes nolēma izpētīt, kā šī vienīgā aminoskābes maiņa ietekmē ātrā antigēna testa veiktspēju.Viņi izmantoja paņēmienu, ko sauc par dziļo mutāciju skenēšanu, lai vienlaikus novērtētu, kā katra vīrusa N proteīna mutācija ietekmē saistīšanos ar diagnostisko antivielu.Viņu rezultāti tika publicēti Cell 2022. gada 15. septembrī.
Pētnieki izveidoja visaptverošu bibliotēku ar gandrīz 8000 N proteīna mutācijām.Šie varianti veido vairāk nekā 99,5% no visām iespējamām mutācijām.Pēc tam viņi novērtēja, kā katrs variants mijiedarbojas ar 17 dažādām diagnostiskām antivielām, ko izmantoja 11 komerciāli pieejamos ātrajos antigēnu testos, tostarp parastajosmājas komplekti.
Komanda novērtēja, kuras N-proteīna mutācijas ietekmē antivielu atpazīšanu.Pamatojoties uz šo informāciju, viņi katrai diagnostikas antivielai izveidoja “bēgšanas mutācijas profilu”.Šis profils identificē specifiskas mutācijas N proteīnā, kas var ietekmēt antivielas spēju saistīties ar savu mērķi.Analīze parādīja, ka antivielas, ko izmanto mūsdienu ātrajos testos, atpazīst un saista visus iepriekšējos un pašreizējos SARS-CoV-2 variantus, kas rada bažas un bažas.
Lai gan vairākas diagnostikas antivielas atpazīst vienu un to pašu N proteīna reģionu, pētnieki atklāja, ka katrai antivielai ir unikāls evakuācijas mutāciju paraksts.Tā kā SARS-CoV-2 vīruss turpina mutēt un ģenerēt jaunus variantus, šos datus var izmantot, lai atzīmētu testa komplekta antivielas, kuras, iespējams, būs jānovērtē atkārtoti.
"Precīza un efektīva inficētu personu identificēšana joprojām ir būtiska stratēģija COVID-19 mazināšanai, un mūsu pētījums sniedz informāciju par turpmākajām SARS-CoV-2 mutācijām, kas varētu traucēt atklāšanu," sacīja Ortlunds."Šeit izklāstītie rezultāti ļauj mums ātri pielāgoties šim vīrusam, jo ​​turpina parādīties jauni varianti, kas rada tūlītējas klīniskas un sabiedrības veselības sekas."
Pamatinformācija: Mutation Deep Scan atklāj evakuācijas mutācijas SARS-CoV-2 nukleokapsīdā, izmantojot pašlaik pieejamos ātro antigēnu testus.Frank F., Kin MM, Rao A., Bassit L., Liu H, Bowers HB, Patel AB, Kato ML, Sullivan JA, Greenleaf M., Piantadosi A., Lam VA, Hudson VH, Ortlund EA cell.2022. gada 15. septembris;185(19):3603-3616.e13.Iekšlietu ministrija: 10.1016/j.cell.2022.08.010.2022. gada 29. augusts, PMID: 36084631.
Finansējums: Nacionālais biomedicīnas attēlveidošanas un bioinženierijas institūts NIH (NIBIB), Nacionālais diabēta, gremošanas un nieru slimību institūts (NIDDK) un Nacionālais alerģijas un infekcijas slimību institūts (NIAID), Amerikas Sirds asociācija.
NIH Research Matters ir iknedēļas atjauninājums par galvenajiem NIH pētījumu rezultātiem, ko pārskatījuši NIH eksperti.To publicē Nacionālo veselības institūtu direktora Komunikācijas un sabiedrisko lietu birojs.